傅立叶变换质谱法基于均匀磁场中离子的旋涡运动。回旋加速器频率，半径，速度和能量的示例是离子质量和离子电荷以及磁场强度的函数。
通过空间均匀的RF场（激励电场），当离子的回旋加速器频率与激励RF场频率（共振）相同时，离子将相位加速到更大的半径卷积，从而产生可接受的图像。电流信号。
傅里叶变换方法中使用的RF范围涵盖了待测量的质量范围。同时激发所有离子，并通过福利叶转换过程将检测到的信号转换成质谱。
最早的ICR MS可以追溯到E.O.劳伦斯的策略。 1950年，Sommer.Thomas和Hipple开发出第一台实用的回旋加速器质谱仪。
事实上，Marshall和Comisarow在1974年使用FT方法处理ICR数据，这是离子回旋共振质谱历史的新篇章。随后，傅立叶变换离子回旋共振质谱仪的仪器设计和应用得到了迅速发展。
傅里叶变换质谱仪是一种高分辨率质谱仪，具有高精度和快速数据采集。它可以连接多种电离方法，可以进行多级质谱MS检测，并在化合物的相对分子质量测量，结构信息采集和反应机理中发挥重要作用。
近年来，它已成为生物大分子研究中的一种罕见工具，具有基质辅助激光解吸电离MALDI和电喷雾电离ESI。